По одной из версий, название местечка произошло от названия речки ХОРСУНА, правый приток реки МАРТАНКИ. Горцы обычно ХОРСУ называют отведенный от реки канал для водяной мельницы. «ХЕРАН ХОРСУ» - мельницы канал. Другое возможное происхождения названия «ХОР-СУ, ХАРСА» (чеч.) «рыжий». ХОРСУ ХАЧ - «алыча».

с. Харсеной основано в 1905-м году после выкупа земель у царского наместника Исой Никаевым. До оккупации территория Харсеноя царскими войсками на этой территории никто не жил и там не было никаких сел или хуторов кроме древних захоронений предков чеченцев бронзового века. На территории ХОРСУНА был очень густой лес и много диких животных. Чеченцы тейпа Мулкой из высокогорья часто спускались туда для охоты, для выпаса скота и рубки леса, и контролировали эту территорию как часть своего тейповой территории, но на постоянное жительство пришли туда позже, как только численность населения в горах стало стремительно расти...